《经济研究》1998年被国家新闻出版署评定为“全国百种重点社科期刊”, 2000年获第二届“全国百种重点社科期刊奖”和首届“国家期刊奖”两项大奖,2002年又获第二届“国家期刊奖”,是唯一入选的经济理论刊物。
《经济研究》在近年公布的由南京大学和香港科技大学合作研制的《中文社会科学引文索引》(CSSCI)统计结果中,影响因子、被引总次数和被引指数在社科期刊中连续名列第一。在2005和2007年公布的我国经济学最高奖——孙冶方经济科学奖的评选结果中,有5篇和6篇论文获得论文奖,占该奖项论文奖总数的50%、60%。